Tủ an toàn sinh học loại A1 và A2 70% khối lượng không khí được sử dụng tuần hoàn, 30% là tủ xả, tủ an toàn sinh học loại B1 70% khí được xả ra ngoài, 30% được sử dụng tuần hoàn, tủ an toàn sinh học loại B2 100% khí được xả ra ngoài, khí không được sử dụng tuần hoàn.
Việc xả tủ an toàn sinh học thứ cấp có cần ống xả bên ngoài hay không, nên được quyết định theo các mô hình khác nhau, nếu đó là tủ an toàn sinh học loại A1 và A2, thường không yêu cầu kết nối ống xả bên ngoài, có thể được sử dụng tuần hoàn trực tiếp trong phòng thí nghiệm. Nếu cần phải xả khí ra ngoài phòng thí nghiệm, khí nên được xả ra ngoài phòng thí nghiệm dưới dạng nắp xả áp suất âm (dạng kết nối mềm) thay vì kết nối cứng và khí thải cần được xả sau khi lọc bằng bộ lọc HEPA.
Tủ an toàn sinh học loại B1 và B2 thường yêu cầu khí được thải trực tiếp ra ngoài trời thông qua ống xả bên ngoài (kết nối cứng), khí không được tái chế, lượng khí thải của hệ thống thoát khí phải phù hợp với lượng không khí của tủ an toàn sinh học và lượng không khí trong phòng thí nghiệm, và liên kết với nhau để đảm bảo sử dụng và an toàn môi trường.